Simone简单重复序列
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简单重复序列（Simple Sequence Repeat，SSR）是指重复单位长度和碱基组成基本一致，仅有少数基因存在微小差异的短串联重复序列，又称微卫星序列 。该序列于1982年由Hamade等人发现，真核生物基因组中按基序长度可分为卫星DNA、小卫星DNA、微卫星DNA和中卫星DNA。SSR通过设计两端保守序列引物进行PCR扩增，利用电泳分析长度多态性，具有多态性高、重复性好等特点，但需特异性引物设计 。
SSR标记技术基于DNA变异，广泛应用于遗传图谱构建、种群遗传结构分析和分子辅助育种等领域 。在玉米育种中，SSR通过DNA指纹图谱降低环境干扰，维系条带稳定性，实现种质资源纯度测定 。板栗全基因组研究中筛选出312,302个SSR标记，二核苷酸重复序列占82.67%，（AT）n为基元主要类型，其开发的引物对燕山板栗古树实现唯一性DNA指纹编码 。柞蚕转录组数据中检索到15,568个SSR位点，筛选出12对稳定多态性引物，为分子标记辅助育种提供技术支持 。
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